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CYTOARRAY®: UN MICROARRAY CROMOSÓMICO PARA CADA INDICACIÓN

Junto a nuestro representado Bioarray España contamos con la línea completa de tests llamada Cytoarray®, también denominado array, microarreglos, o aCGH, cada uno con diferentes aplicaciones que se describen a continuación.

Características

Cytoarray comprende diferentes test de array CGH basados en los diseños de ISCA (International Standards for Cytogenomic Array Consortium), y adaptados adicionalmente para cada aplicación específica.

Todos los Cytoarray son aCGH de genoma completo, pero con mayor densidad de sondas (resolución), en regiones cromosómicas de mayor implicación clínica, con el fin de maximizar el rendimiento diagnóstico.

Adicionalmente existe el Cytoarray® CGH + SNP para la detección de disomías uniparentales y pérdida de heterocigosidad.

Tipos y recomendaciones

Cytoarray 60K

Número de sondas: 60K

Cobertura

  • Target: 1 sonda cada 48 Kb
  • Backbone: 1 sonda cada 70 Kb

Resolución CGH

  • Target: 250 Kb
  • Backbone: 350 Kb

Principales aplicaciones clínicas

  • Retraso en el desarrollo / discapacidad intelectual
  • Anomalías congénitas múltiples (ACM)

Cytoarray 180K

 

Número de sondas: 180K

Cobertura

  • Target: 1 sonda cada 19 Kb
  • Backbone: 1 sonda cada 25 Kb

Resolución CGH

  • Target: 95 Kb
  • Backbone: 125 Kb

Principales aplicaciones clínicas

  • Retraso en el desarrollo / discapacidad intelectual
  • Fenotipos sugestivos de síndromes cromosómicos específicos

Cytoarray Autismo

Mayor información y recursos adicionales sobre Autismo se encuentran contemplados en apartado “Autismo”, dentro de la sección de especialistas de este sitio web.

Número de sondas: 400K y 180K

Cobertura

  • Target: 1 sonda cada 2-3 Kb
  • Backbone: 1 sonda cada 7 Kb

 

Resolución CGH

  • Target: 15 Kb
  • Backbone: 35 Kb

Principales aplicaciones clínicas

  • Trastornos del Espectro Autista (TEA)

 

Cytoarray UPD

Número de sondas: 400K

Cobertura

  • Target: 1 sonda cada 19 Kb
  • Backbone: 1 sonda cada 25 Kb

Resolución CGH

  • Target: 95 Kb
  • Backbone: 125 Kb

Resolución LOH (Lost of Heterozygosity = Pérdida de Heterocigosidad): 10 Mb

Principales aplicaciones clínicas

  • Sospecha clínica de pérdida de heterocigosidad (LOH), o Disomía Uniparental (UPD)

 

Cytoarray Prenatal

 

Número de sondas: 60K

Cobertura

  • Target: 1 sonda cada 40 Kb
  • Backbone: 1 sonda cada 100 Kb

Resolución CGH

  • Target: 200 Kb
  • Backbone: 500 Kb

Principales aplicaciones clínicas

  • Test prenatal con líquido amniótico o biopsia corial

 

Cytoarray DACRA

(Detección de Anomalías Cromosómicas en Abortos)

 

Mayor información y recursos adicionales sobre DACRA se encuentran contemplados en apartado “Detección de Anomalías Cromosómicas en Abortos”, dentro de la sección de especialistas de este sitio web.

Número de sondas: 60K

Cobertura

  • Target: 1 sonda cada 40 Kb
  • Backbone: 1 sonda cada 100 Kb

Resolución CGH

  • Target: 200 Kb
  • Backbone: 500 Kb

Principales aplicaciones clínicas

Productos de la concepción (aborto espontáneo).

Preanalítica y resultados

Cytoarray, Cytoarray Plus, Cytoarray Autismo, Cytoarray UPD

 

Muestra: 3 a 4 mL de sangre, en tubo tapa lila con anticoagulante K3EDTA.

Ayuno: no requerido

Tiempo de resultados: 30 días, aproximadamente.

 

Cytoarray Prenatal

Muestra: líquido amniótico y biopsia corial, en recipiente estéril como jeringuilla descartable de 10 mL, tubo Falcon autoclavado o esterilizado.

Favor adicionar muestras de sangre materna y paterna (o excepcionalmente sólo muestra materna, en casos en que no esté disponible la muestra paterna). Estas muestras de sangre se deben tomar en tubo tapa lila (anticoagulante K3EDTA), un tubo de 3 – 4 mL por paciente.

Tiempo de resultado: 7 a 10 días.

 
Cytoarray DACRA

Muestra: restos abortivos en tubo o recipiente estéril con suero fisiológico.

Tiempo de resultado: 4- 5 semanas.


Recursos adicionales

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PANEL DE PORTADORES DE FIBROSIS QUISTICA

En este estudio, se puede conocer, a partir de una muestra de sangre  si una persona es portadora de alguna de las 50 mutaciones o alteraciones más frecuentes en el gen CFTR, las cuales son causantes de Fibrosis Quística (FQ); enfermedad de herencia recesiva que provoca la acumulación de moco espeso en órganos del sistema respiratorio y digestivo, produce fallas sistémicas, y es potencialmente mortal.

Características

Secuenciación masiva de las regiones codificantes y zonas adyacentes del gen CFTR mediante NGS, y análisis de las 50 mutaciones más frecuentes.

Mutaciones analizadas

CFTRdele 2,3

711+1G>T

V520F

2143delT

M1101K

E60X

L260W

1717-1G>A

2184delA

D1152H

P67L

1078delT

G542X

2347delG

R1158X

G85E

R334W

S549N

W846

R1162X

394delTT

R347P

S549R T>G

2789+5G>A

3659delC

444delA

R347H

G551D

Q890X

3849+10kbC>T

R117C

A455E

R553X

3120+1G>A

S1251N

R117H

I507del

R560T

3272-26A>G

390insT

Y122X

F508del

1811+1.6kbA>G

R1066C

W1282X

621+1G>T

1677delTA

1898+1G>A

Y1092X(C>A)

N1303K

Recomendaciones

  • Personas con antecedentes familiares de fibrosis quística
  • Niños en los que se sospeche fibrosis quística
  • Donantes de óvulos o semen, para clínicas de reproducción asistida

Preanalítica y resultados

  • Muestra: 2 tubos de 3 – 4 mL de sangre cada uno (tubos con anticoagulante K3EDTA, tapa lila)
  • Ayuno: No requerido
  • Tiempo de entrega de resultados: 30 días

Recursos adicionales

Los formatos de solicitud y consentimiento informado están disponibles a solicitud del especialista. Por favor comuníquese con nosotros al: 0983001590

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BIOEXOME®: SECUENCIACIÓN DE EXOMA

Bioexome es la línea de servicio de secuenciación masiva (NGS, Next Generation Sequencing) de Bioarray, para exoma y paneles por exoma. Las patologías más adecuadas de ser estudiadas por exoma, son aquellas que presentan alta variabilidad desde el punto de vista clínico y genético.

Algunas ventajas son:

  • Reducción de costo.
  • Posibilidad de iniciar el análisis con 30 genes, y si no existe hallazgo, es posible ampliar el test sólo con cancelación de diferencia de precio.
  • Diseños a medida: los paneles de genes pueden ser sugeridos por usted, como especialista, o pueden ser diseñados por nuestro departamento de consejo genético sin costo adicional.

Tipos y recomendaciones

Bioexome 15

Comprende hasta 15 genes de la enfermedad de sospecha.

Principales aplicaciones clínicas:

Enfermedades genéticas con patologías bien definidas.

Bioexome 30

Comprende la secuenciación de hasta 30 genes asociados a la enfermedad de sospecha. En caso de no haber hallazgo dentro de los 30 genes estudiados, se puede ampliar el estudio a solicitud del médico con diferencia de costo.

 

Principales aplicaciones clínicas:

Enfermedades genéticas con presentación de patologías bien definidas, como rasopatías, Charcot Marie Tooth, fiebre mediterránea.

Bioexome 100

Secuenciación y análisis de hasta 100 genes asociados a la enfermedad que se sospecha.

Principales aplicaciones clínicas:

Está indicado para patologías multigénicas o con fenotipos no específicos de un grupo reducido de genes, como: ciliopatías, displasias esqueléticas, cardiopatías, patología mitocondrial, etc.

Bioexome 500

Consiste en la secuenciación de exoma clínico y análisis de 500 genes asociados a la enfermedad que se sospecha.

Principales aplicaciones clínicas:

Patologías en las que existe una multitud de genes implicados, o en las que no se conoce a priori, cuáles son los genes implicados con fenotipos no específicos.

Bioexome Clinic

Secuenciación de exoma clínico y análisis de más de 6200 genes.

Bioexoma Neonatal

Está orientado a servicios de neonatología.

Se analizan 800 genes predefinidos y los resultados se entregan en 30 días.

Bioexome Optima

Es la secuenciación de exoma completo, con entrega de hallazgos, pero SIN interpretación clínica.

Esta opción es más costo-efectiva y se entrega en un plazo de 60 días.

Bioexome y Bioexome Trio

Es la secuenciación del exoma completo (más de 20 mil genes).

Es un estudio especialmente eficiente cuando se incluyen a otros miembros de la familia en el análisis, por ejemplo los padres (Bioexome Trio).  

Puede ser útil para valorar la probabilidad para los padres, de tener otro hijo con la misma patología.

Se puede incluir en el estudio a los hermanos del niño, o incluso familiares más lejanos. La decisión relativa a qué personas analizar se toma en consulta médica, con base en la valoración de la estructura de la familia y quién está afectado por la patología. Los datos de los familiares NO se interpretan, por lo que en el estudio de Trio, se emite un solo informe.

Preanalítica y resultados

  • Muestra (para todos los tipos de Bioexome)
  • Adultos y niños grandes: 3 a 4 mL de sangre en tubo tapa lila, con anticoagulante K3EDTA.
  • Bebés y niños pequeños: se puede tomar menor volumen. 1 mL de sangre en vial pediátrico tapa lila, con anticoagulante K3EDTA.
  • Temperatura de mantenimiento de la muestra: ambiente, refrigerado, o con icepacks (para transportación). NUNCA congelar.
  • Tiempo  de resultado:
  • Bioexome Neonatal: 30 días
  • Bioexome 15, Bioexome 30, Bioexome 100, Bioexome 500, Bioexome Optima: 60 días
  • Bioexome Clinic: 90 días
  • Bioexome Trio: 90 días

¿Qué ofrecemos de nuevo?

  • A solicitud del especialista, diseñamos paneles de genes y secuenciación por exoma, de forma personalizada, de acuerdo a las necesidades de diagnóstico que el paciente requiere, sin costo adicional.
  • Asesoría remota desde España: los especialistas que lo requieran, pueden solicitar entrevista remota con nuestros genetistas, a fin de discutir casos o consensuar criterios. Si este es su requerimiento, por favor contáctenos en Ecuador, al 098 300 1590, o escriba a través del formulario de este sitio web.

Recursos adicionales

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PANEL NGS INTEGRAL PARA EPILEPSIA

Aproximadamente el 40% de los pacientes con epilepsia manifiesta una herencia genética compleja. De esta manera, Bioarray, nuestro laboratorio en España ha basado el diseño de este panel en los contenidos de las principales bases de datos genéticas, según hallazgos científicamente reportados.

Características

  • Panel más amplio del mercado, con el máximo poder diagnóstico.
  • Secuenciación costo – efectiva de hasta 538 genes asociados a más de 50 tipos de epilepsia.

Algunos tipos de epilepsia estudiados:

  • Epilepsias benignas
  • Epilepsia mioclónica progresiva
  • Epilepsia autosómica dominante
  • Epilepsia borderline
  • Encefalopatía epiléptica
  • Epilepsia generalizada
  • Epilepsia parcial
  • Epilepsia mioclónica con fibras rojas rasgadas.

Paneles

  • Panel de 15 genes
  • Panel de 44 genes
  • Panel de 538 genes

Ver mayor información en sección “Recursos Adicionales” (folletos descargables).

Recomendaciones

  • Confirmación molecular de un diagnóstico previo.
  • Para conocer la etiología de la enfermedad y  facilitar toma de decisiones con respecto al tratamiento.
  • Para la realización de pruebas familiares, en la detección de mutaciones específicas conocidas, previamente identificadas en algún miembro afectado.

Preanalítica y resultados

  • Muestra: 3 a 4 mL de sangre, en tubo tapa lila con anticoagulante K3EDTA. En caso de bebés o niños muy pequeños, puede tomarse un vial pediátrico de 1 mL tapa lila (K3EDTA). Mantener a temperatura ambiente, refrigerado (2-8ºC), o con icepacks. NUNCA congelar.
  • Ayuno: no requerido.
  • Tiempo de resultados: 30 días.

Recursos adicionales

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PANEL PARA ENFERMEDADES MITOCONDRIALES

En las enfermedades mitocondriales se caracterizan por fenotipos complejos dentro de un amplio espectro, que van desde encefalopatía, así como daño muscular, o de órganos como hígado, riñones, corazón, etc.  Esta variabilidad de manifestaciones clínicas puede explicarse por diferentes mutaciones en el ADN mitocondrial (ADNmt) y el ADN nuclear que codifica las subunidades proteicas de la cadena respiratoria.

Algunas patologías de origen genético relacionadas con cambios en determinados genes mitocondriales, y que es conveniente vigilar su diagnóstico apropiado:

  • Neuropatia hereditaria de Leber
  • Sindrome de Leigh
  • Diabetes y sordera heredada por vía materna
  • Encefalopatía mitocondrial
  • Epilepsia mioclónica
  • Neuropatía, ataxia, y retinosis pigmentaria
  • Sordera no sindrómica
  • Queratodermia palmoplantar con sordera
  • Oftalmoplegia externa progresiva

Con base a lo anterior, Genostics – Elige Ciencia junto a Bioarray España ofrece el Panel Complejo I Mitocondrial, acoplado a la secuenciación del ADN mitocondrial.

Características

Panel de 30 genes del Complejo I mitocondrial, que incluye el estudio de los genes nucleares asociados con el déficit del Complejo I, y la secuenciación del ADN mitocondrial (37 genes).

Recomendaciones

  • Confirmación molecular de un diagnóstico clínico previo
  • Para facilitar la toma de decisiones para establecer un tratamiento adecuado
  • Para realización de pruebas familiares, en la detección de mutaciones específicas conocidas, previamente identificadas en algún miembro afectado.

Preanalítica y resultados

  • Muestra: 3 a 4 mL de sangre, en tubo tapa lila con anticoagulante K3EDTA. En caso de bebés o niños muy pequeños, puede tomarse un vial pediátrico de 1 mL tapa lila (K3EDTA). Mantener a temperatura ambiente, refrigerado (2-8ºC), o con icepacks. NUNCA congelar.
  • Ayuno: no requerido
  • Tiempo de resultados: 30 días.

Recursos adicionales

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CYTOARRAY 400K®: AUTISMO

Los Trastornos del Espectro Autista (TEA) son un conjunto de patologías del neurodesarrollo (Autismo, Síndrome de Asperger, Trastorno Generalizado Inespecífico del Desarrollo, los cuales tienen un fuerte componente genético y tienen una alta prevalencia en la población.

Con Bioarray, contamos con un array de diseño propio para el estudio de los Trastornos del Espectro Autista (TEA). Array CGH se ha demostrado muy útil como primera tecnología de elección en el estudio de este tipo de pacientes.

Características

  • Prueba de desarrollo propio: única prueba en el mercado específica para el estudio del autismo con 400 mil sondas,  distribuidas de manera no uniforme, en 1980 regiones del genoma, con relación científicamente demostrada con TEA.
  • Alto rendimiento diagnóstico.
  • Detección de variantes de número de copia (CNVs) de tipo recurrente, como también, la microdeleción/microduplicación 16p11.2.
  • Cobertura:
    Target: 1 sonda cada 2-3 Kb
    Backbone: 1 sonda cada 7 Kb

  • Resolución CGH
    Target: 15 Kb
    Backbone: 35 Kb

Recomendaciones

Pacientes con indicios de trastorno de espectro autista, los cuales pueden incluir características de trastorno generalizado inespecífico del desarrollo y síndrome de Asperger.

Preanalítica y resultados

  • Muestra: 3 a 4 mL de sangre, en tubo tapa lila con anticoagulante K3EDTA. En caso de bebés o niños muy pequeños, puede tomarse un vial pediátrico de 1 mL tapa lila (K3EDTA). Mantener a temperatura ambiente, refrigerado (2-8ºC), o con icepacks. NUNCA congelar.
  • Ayuno: no requerido
  • Tiempo de resultados: 30 días.

Recursos adicionales

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Diagnóstico Genético En Abortos

(Cytoarray DACRA®)

Es un análisis por array  (microarreglos), de creación propia, que permite identificar alteraciones cromosómicas exclusivamente en productos de abortos espontáneos.

Aproximadamente el 15% de los embarazos terminan en aborto espontáneo. Las causas pueden ser variadas, sin embargo, el componente genético ha demostrado jugar un papel preponderante.  Por ejemplo,  la presencia de traslocaciones recíprocas en alguno de los miembros de la pareja, que aunque no presentan un fenotipo particular, producen gametos con traslocaciones no balanceadas.

Características

  • Superior a la técnica FISH, que requiere cultivo y crecimiento de células selectivas
  • Requiere poco material de partida
  • Mayor resolución: 10 veces con respecto al cariotipo convencional
  • Ventaja: NO requiere cultivo de células
  • Provee información relevante a fin de poder planificar y tomar prevenciones en embarazos futuros.

Recomendaciones

  • Abortos a repetición de causa desconocida
  • Parejas con embarazos interrumpidos de forma espontánea
  • Diagnóstico genético en abortos,

Preanalítica y resultados

  • Muestra: restos de legrado (fetales y corioplacentarios), lavados con suero fisiológico estéril preferiblemente en quirófano, dentro de envase estéril (envase de colección de orina estéril). Por favor NO enviar restos endometriales, puesto que no son viables para el estudio.
  • Mantener en refrigerado o con icepacks hasta el momento del transporte local.
  • Tiempo de resultado: 45 días

Recursos adicionales

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Qf – Pcr Para Anomalías Cromosómicas Fetales

QF-PCR es una metodología que cuantifica el número de cromosomas 13, 18, 21, X e Y mediante el estudio de varias secuencias de ADN polimórficas denominadas repeticiones cortas en tándem (“short tandem repeats: STR”).  Se puede realizar a partir de muestras de líquido amniótico, muestra de vellosidades coriales, o restos fetales de un aborto espontáneo.

Características

  • Sensibilidad y especificidad capaz de detectar trisomías y aneuploidías: en los cromosomas 13, 18, 21, X e Y.
  • Obtención de resultado en más del 99% de los casos.
  • Ventaja importante: NO requiere cultivo celular.
  • Riesgo residual del 0,05% en caso de resultado favorable.
  • Se puede emplear en embarazos gemelares dicigóticos, en tanto se tengan muestras de cada saco amniótico.

Recomendaciones

  • Edad materna avanzada (mayor a 35 años en caso de embarazo simple)
  • Screening de primero o segundo trimestre positivo,
  • Existen anomalías en la ecosonografía.
  • Análisis de restos fetales, en caso de aborto espontáneo.

Preanalítica y resultados

Muestra

  • Líquido amniótico, en envase estéril, desde las 14 hasta las 16 semanas de embarazo.
  • Muestra de vellosidades coriales, en envase estéril, a partir de las 12 semanas.
  • Restos de aborto espontáneo, en envase estéril, con suero fisiológico estéril.
  • Sangre materna: es conveniente acompañar una de las muestras anteriores con sangre materna, 4 mL en tubo tapa lila, con anticoagulante K3EDTA, para el descarte de contaminación materna. No requiere ayuno.

Tiempo de resultado: 7 días

Restricción por minoría de edad: Este servicio no está disponible para mujeres embarazadas menores de edad, que a la fecha de su última menstruación no hayan cumplido 18 años.


Recursos adicionales

Qf – Pcr Solicitud Concentimiento

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Análisis De Portadores Para Optimización De Banco De Gametos En Clínicas De Reproducción Asistida

Como genetistas reproductivos apoyamos la gestión de banco de gametos mediante nuestros Análisis de Portadores BIOARRAY ADVANCE HIGH FREQUENCY Y BIOARRAY ADVANCE EXPANDED, análisis de creación propia, a fin de contribuir a la premisa de llevar un bebé sano a casa. BIOARRAY ADVANCE HIGH FREQUENCY es el análisis recomendado en el caso de donantes de gametos, puesto que analiza las enfermedades de herencia recesiva y ligada al sexo más frecuentes.

  • Ofrecemos apoyo profesional en la optimización de bancos de gametos en clínicas de reproducción asistida con criterio de genetistas reproductivos y orientación en todos los casos de parejas que involucren receptores.
  • Estudiamos el matching óptimo entre el/la donante de gametos y su receptor/a, de manera que se reduzca el riesgo reproductivo, optimizando a la vez el uso de los propios bancos de cada centro de reproducción asistida.

Para mayor información y detalles técnicos, visite la página “Análisis de Portadores – Bioarray Advance”, dentro de la sección dedicada a Especialistas de este sitio web.Para mayor información y detalles técnicos, visite la página “Análisis de Portadores – Bioarray Advance”, dentro de la sección dedicada a Especialistas de este sitio web.

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